中国计算机学会于2006年4月13-16日在南京外国语学校召开了2006年全国信息学奥林匹克工作会议，本次会议由江苏省青少年科技中心、江苏青少年信息学奥林匹克竞赛委员会承办，南京外国语学校协办，中国计算机学会（CCF）秘书长、NOI竞赛委员会杜子德、NOI竞赛委员会副主席孟小峰、来自28个省的特派员、江苏省青少年科技中心主任冯少东等相关人员出席会议，相关人员列席了会议。会议由竞赛委员会孟小峰、王晓敏和吴耀斌主持。
关于复赛：CCF将全面推行巡视员监督制度。NOIP提高组复赛在一个考点进行（个别情况特殊的省需要报批的除外）。试题通过邮局寄送至省竞赛委，赛前半小时开封发放。CCF NOI科学委员会将开发一套新的评测系统供各省使用。NOIP复赛提高组当天评测和公布成绩，由选手确认并允许当时申诉和复评。评测结束后，次日将评测结果和选手程序报送CCF，过期无效。选手可自愿参加CCF的复测，CCF将为参加复测的选手颁发证书（标明是否达到了获奖的最低线），参加复测的选手须交纳复测费，CCF仍执行对困难选手实行减免费用的政策，授权各地特派员批准。
关于初赛，会议提出了更为严格的规定：CCF向各省提供的竞赛地点寄送试卷；每个考点（考场）设主监考人1人，副监考人1人；各省赛区须向CCF提交参赛选手名单、填写考场表；参加竞赛时选手不能有任何夹带，每人一桌；考试后当天收卷，10个工作日内结果报送CCF，公布成绩并告知选手本人；不参加初赛，没有资格参加复赛。
会议召开前，先举行NOI竞赛委员会会议，就许多重要问题先行进行了讨论。
会上，各省还交流介绍了各地开展青少年信息学奥林匹克竞赛的做法、经验、存在的问题以及努力的方向。
